La efímera historia de la desaparecida aerolínea Isthmian Airways empieza el 5 de mayo de 1929, cuando realizó su primer viaje desde el puerto de Balboa hasta Colón, en un recorrido que tomaba 30 minutos. Isthmian Airways fue fundada por Ralph Ernest Sexton y contaba con una flota de hidroaviones, modelo “Hamilton H-47”, que salían a las 8am, 12pm y 4pm con rumbo a Colón y viceversa.
La tarifa de vuelo estaba en $10 la ida y $15 la ida y vuelta. El precio se redujo a unos $3 durante 1932-1933, cuando aún se sentían los efectos de la Gran Depresión. La compañía, aparte de los viajes a Colón, también proveía vuelos turísticos a Taboga y Las Perlas.
Por razones desconocidas, el gobierno de la Zona del Canal canceló el contrato de Isthmian Airways el 1 de julio de 1936. Ralph Sexton procedió a demandar al gobierno canalero por la cancelación, aunque no se tiene conocimiento de como terminó el pleito.